Theo đó, Đại học Cần Thơ là cơ sở giáo dục đại học công lập trực thuộc Bộ Giáo dục và Đào tạo, có tư cách pháp nhân, có con dấu và tài khoản riêng, có trụ sở chính tại thành phố Cần Thơ.

Đại học Cần Thơ thực hiện tổ chức lại cơ cấu tổ chức và hoạt động trên cơ sở Trường Đại học Cần Thơ theo quy định của Luật Giáo dục đại học và quy định của pháp luật có liên quan.

Bộ Giáo dục và Đào tạo, Ủy ban nhân dân thành phố Cần Thơ và các cơ quan liên quan theo chức năng, nhiệm vụ, thẩm quyền hướng dẫn, giám sát quá trình chuyển đổi bảo đảm minh bạch, không để xảy ra tiêu cực, thất thoát, lãng phí tài chính, tài sản; không làm ảnh hưởng đến hoạt động bình thường, liên tục của nhà trường; bảo đảm quyền và lợi ích hợp pháp, chính đáng của người học, giảng viên, cán bộ quản lý, người lao động và các tổ chức, cá nhân có liên quan theo quy định của pháp luật.

Quyết định nêu rõ: Hội đồng trường, Chủ tịch Hội đồng trường, Hiệu trưởng của Trường Đại học Cần Thơ tiếp tục thực hiện chức năng, nhiệm vụ, quyền hạn theo các quy định hiện hành cho đến khi Bộ trưởng Bộ Giáo dục và Đào tạo quyết định thành lập Hội đồng Đại học, công nhận Chủ tịch Hội đồng Đại học và công nhận Giám đốc Đại học Cần Thơ theo quy định của pháp luật.

Qua hơn 59 năm xây dựng và phát triển, Trường Đại học Cần Thơ đang đào tạo 19 lĩnh vực, với 121 chương trình đào tạo bậc đại học, 59 chương trình cao học và 24 chương trình nghiên cứu sinh trình độ tiến sĩ. Quy mô đào tạo của trường hơn 47.000 sinh viên đại học, học viên sau đại học. Trường có hơn 1.000 viên chức và người lao động. Trường có 58,5% giảng viên có trình độ tiến sĩ, 24 giáo sư và 182 phó giáo sư.

Hiện nay Trường đại học Cần Thơ đang có 6 trường thành viên gồm: Trường Bách khoa, Trường Công nghệ thông tin và Truyền thông, Trường Kinh tế, Trường Nông nghiệp, Trường Sư phạm, Trường Thủy sản. Ngoài ra, trường còn có 10 khoa, 3 viện nghiên cứu và 1 Trường THPT Thực hành Sư phạm.