Sân bay Tokyo Narita (NRT) là sân bay quốc tế tại Narita, Chiba, thuộc phía Đông của vùng siêu đô thị Tokyo. Sân bay NRT phục vụ phần lớn các chuyến bay quốc tế đi/đến Nhật Bản và cũng là điểm kết nối hàng không chính giữa châu Á và châu Mỹ. Năm 2012, sân bay phục vụ hơn 32,8 triệu lượt khách thông qua, trong đó số lượng khách quốc tế chiếm chủ yếu với 29,6 triệu lượt, khách nội địa chiếm hơn 3,2 triệu lượt khách. Đây cũng là sân bay vận chuyển hàng hóa lớn thứ 2 Nhật Bản và lớn thứ 3 thế giới (đạt gần 2 triệu tấn năm 2012).

Sân bay Tokyo Haneda (HND) cùng với sân bay NRT là hai sân bay chính phục vụ phần lớn hành khách đi/đến Tokyo. Theo định hướng của chính phủ Nhật Bản trước đây, sân bay HND chủ yếu phục vụ các chuyến bay nội địa trong khi sân bay NRT đảm trách khai thác hầu hết các chuyến bay quốc tế. Năm 2010, sân bay HND chính thức hoàn thành nhà ga quốc tế và đưa vào sử dụng đường băng thứ tư, nâng công suất khai thác lên đạt 90 triệu lượt khách/năm. Sân bay HND có nhiều ưu điểm như vị trí địa lý thuận lợi nằm sát thành phố (14km từ trung tâm Tokyo), phương tiện giao thông công cộng phát triển, nối chuyến nội địa thuận tiện. Năm 2012, sân bay HND thông qua gần 67 triệu hành khách, trở thành sân bay tấp nập thứ 4 thế giới và thứ 2 trong khu vực châu Á.