Đã có 14 cá nhân liên quan vụ “biệt phủ” Yên Bái bị xử lý kỷ luật về mặt Đảng và chính quyền. Với những cán bộ, công chức cấp phòng trở xuống thuộc TP Yên Bái, Ban Thường vụ Thành ủy đã kỷ luật với hình thức khiển trách về Đảng, Chủ tịch UBND TP đã quyết định kỷ luật khiển trách về mặt chính quyền.
Chủ tịch UBND phường Minh Tân và cán bộ địa chính phường đã bị kỷ luật.
Cục trưởng Cục Thuế tỉnh Yên Bái đã quyết định kỷ luật khiển trách đối với 2 cán bộ, công chức của Chi cục Thuế TP Yên Bái.
Cơ quan chức năng tỉnh đã xử phạt số tiền 507 triệu đồng do xây dựng trái phép và không phép tại khu “biệt phủ” của gia đình nguyên Giám đốc Sở TN&MT Phạm Sỹ Quý và phạt chậm nộp thuế hơn 51 triệu đồng.