Mới đây, Cơ quan Cảnh sát điều tra Bộ Công an đã ban hành kết luận điều tra bổ sung vụ án “vi phạm quy định về kế toán gây hậu quả nghiêm trọng; in, phát hành, mua bán trái phép hóa đơn, chứng từ thu nộp ngân sách Nhà nước”, xảy ra tại Công ty TNHH Thành An Hà Nội, Công ty TNHH Thiết bị y tế Danh, Công ty TNHH Thiết bị y tế Tràng Thi và các đơn vị liên quan.

Trước đó, cuối tháng 8/2024, cơ quan điều tra đã công bố kết luận điều tra vụ án, chuyển hồ sơ sang Viện Kiểm sát Nhân dân tối cao đề nghị truy tố 38 bị can về các tội danh trên.

Tuy nhiên sau đó, Viện Kiểm sát đã trả hồ sơ, yêu cầu điều tra bổ sung, làm rõ việc gây thất thoát tiền thuế từ hành vi này có dấu hiệu của tội “trốn thuế”.

Nguyễn Đăng Thuyết và Nguyễn Thị Hòa hiện đang bị truy nã. Ảnh: Bộ Công an

Căn cứ kết luận điều tra bổ sung, Cơ quan Cảnh sát điều tra giữ nguyên quan điểm kết luận và đề nghị truy tố trong bản kết luận điều tra ban hành trước đó, bởi hành vi mua, sử dụng hóa đơn khống, gây thiệt hại hơn 743 tỷ đồng của Nguyễn Đăng Thuyết và các bị can có liên quan cấu thành tội “vi phạm quy định về kế toán gây hậu quả nghiêm trọng” đã được khởi tố, kết luận điều tra, do đó không xem xét xử lý tội “trốn thuế”.

Kết luận điều tra thể hiện, bị can Nguyễn Đăng Thuyết thành lập và điều hành Công ty Thành An Hà Nội, Công ty Thiết bị Y tế Danh và Công ty Thiết bị y tế Tràng Thi, hoạt động trong lĩnh vực cung cấp vật tư y tế, phân phối cho một số hãng sản xuất thiết bị y tế, vật tư tiêu hao.

Trong đó, Nguyễn Đăng Thuyết giữ vai trò Tổng giám đốc Công ty Thành An Hà Nội; Nguyễn Nhật Linh (vợ Thuyết) là Phó tổng giám đốc; Nguyễn Thị Hòa, phụ trách kế toán 3 công ty trên.

Cơ quan điều tra xác định, Thuyết và Linh đã chỉ đạo bộ phận kế toán lập hai hệ thống sổ sách kế toán tài chính, trong đó 1 hệ thống đưa số liệu khống, tăng chi phí đầu vào để kê khai, báo cáo cơ quan thuế; hệ thống còn lại để theo dõi số liệu thực tế, nhằm che giấu lợi nhuận thực tế, giảm tiền thuế phải nộp để hưởng lợi bất chính.

Với vai trò là giám sát kế toán thuế, phụ trách kế toán của cả 3 công ty, Nguyễn Thị Hòa đã cùng với Bùi Thị Mai Hương, Kế toán trưởng của Công ty Thiết bị y tế Danh liên hệ với 32 bị can điều hành 110 công ty, hộ kinh doanh để duy trì việc mua, bán hóa đơn khống cho các công ty này.

Hòa phụ trách lập kế hoạch dự tính số tiền thuế phải nộp trong năm, mức “chi phí” mua hóa đơn...trình Nguyễn Đăng Thuyết, Nguyễn Nhật Linh phê duyệt.

Từ đó, Hòa và Hương đã liên hệ, thỏa thuận với các đầu mối có công ty, hộ kinh doanh để mua, bán hóa đơn khống. Hằng tháng, Hương lập bảng kê các đơn hàng để gửi cho các đầu mối bán hóa đơn.

Kết quả điều tra xác định, từ năm 2017 đến 2022, Hòa và Hương đã giúp Thuyết mua 19.167 hóa đơn khống của các mặt hàng là danh mục vật tư y tế, với tổng giá trị tiền hàng trước thuế là gần 3.690 tỷ đồng, thuế VAT là 75,6 tỷ đồng, với tổng chi phí mua hóa đơn gần 257,5 tỷ đồng.

Các hóa đơn khống này được Hòa và Hương cập nhật vào phần mềm kế toán thuế nhằm tăng chi phí, giảm thuế phải nộp; còn phần chi phí mua hóa đơn khống và các phần thực thu, thực chi khác được Đỗ Thị Hoa, kế toán trưởng Công ty Thành An theo dõi trên phần mềm sổ kế toán nội bộ.

Hành vi sử dụng 19.167 hóa đơn khống để kê khai khấu trừ thuế GTGT hàng hóa dịch vụ mua vào đã gây thiệt hại cho ngân sách Nhà nước hơn 62 tỷ đồng.

Số hóa đơn này được sử dụng để hạch toán kế toán khi làm báo cáo tài chính, hạch toán chi phí xác định số thuế phải nộp cũng gây thiệt hại cho Nhà nước gần 681 tỷ đồng.