Hiện tổng số lỗ luỹ kế của các công ty nông, lâm nghiệp lên tới 1.071 tỷ đồng, chiếm 4% vốn chủ sở hữu. Hoạt động kém hiệu quả, quy mô nhỏ bé và hàng loạt vướng mắc khác khiến quá trình CPH của các công ty này diễn ra chậm chạp.