Công văn này khẳng định: “Chai phân bón 1 lít của Công ty Thuận Phong có nhãn hàng hóa bao bì ghi chỉ dẫn giả mạo về nguồn gốc thương nhân khác (nước ngoài) giả mạo nơi sản xuất đóng gói hàng hóa. Theo quy định tại điểm đ, e, khoản 8 Điều 3 Nghị định 185/2013/NĐ-CP thì hàng hóa có nhãn vi phạm như trên là hàng giả”.

Lý giải cho kết luận này, Bộ Khoa học và Công nghệ viện dẫn khoản 3 Điều 2 Nghị định 89/2006/NĐ-CP của Chính phủ về nhãn hàng hóa: Nhãn gốc của hàng hóa là nhãn thể hiện lần đầu được gắn lên hàng hóa.

Cơ quan chức năng đang tiến hành kiểm tra kho hàng của Thuận Phong vào tháng 4/2015.

Tại khoản 3 Điều 9 Nghị định 89/2006/NĐ-CP cũng quy định hàng hóa nhập khẩu vào Việt Nam mà trên nhãn chưa thể hiện hoặc thể hiện chưa đủ nội dung bắt buộc bằng tiếng Việt thì phải có nhãn phụ thể hiện những nội dung bắt buộc bằng tiếng Việt và giữ nguyên nhãn gốc của hàng hóa. Nội dung ghi bằng tiếng Việt phải tương ứng với nội dung thi trên nhãn gốc.

Vì vậy, theo quy định trên thì chai phân bón 1 lít của Công ty Thuận phong có gắn nhãn gốc bằng tiếng nước ngoài, nhãn phụ bằng tiếng Việt ghi rõ “Phân Mỹ nhập khẩu” được hiểu là hàng hóa nhập khẩu.

Tuy nhiên, trong thực tế loại chai phân bón trên là do Công ty Thuận Phong sản xuất chứ không phải được nhập khẩu nguyên ở dạng chai 1 lít. (Mặt khác, ở khoản 1 Điều 3 Nghị định 185/2013/NĐ-CP của Chính phủ về xử phạt vi phạm hành chính trong hoạt động thương mại sản xuất, buôn bán hàng giả hàng cấm bảo vệ quyền lợi người tiêu dùng quy định “sản xuất” là việc thực hiện một số hoặc tất cả hoạt động chế tạo, chế bản, in gia công đặt hàng sơ chế, pha trộn sang chiết nạp, đóng gói và hoạt động khác làm ra hàng hóa).
Trước đó,  Báo Đầu tư đã đăng tải loạt bài "Từ vụ bắt quả tang đến “nghi án” sản xuất phân bón giả” tại Công ty cổ phần Sản xuất thương mại Thuận Phong từ tháng 9 đến tháng 12/2015. 

Theo đó, ngày 24/4/2015, Đoàn công tác gồm các thành viên Văn phòng thường trực Ban Chỉ đạo quốc gia chống buôn lậu, gian lận thương mại và hàng giả quốc gia (Ban 389) phối hợp với Thanh tra Bộ Quốc phòng,  Ban Chỉ đạo 398 Đồng Nai, Cơ quan Công an tỉnh Đồng Nai, Sở Tài nguyên và Môi trường, Chi cục Quản lý thị trường tỉnh Đồng Nai… kiểm tra hoạt động sản xuất, kinh doanh của Công ty Thuận Phong.

Tại thời điểm kiểm tra, nhân viên của Thuận Phong đang tiến hành dán nhãn mác, sang chiết, đóng gói “phân bón được nhập khẩu từ Mỹ”. Kiểm kê sơ bộ, đoàn xác định có 3.224 chai phân bón các loại (tương đương hơn 4 tấn) được dán nhãn hàng hóa xuất xứ từ Mỹ (Made in USA). Đoàn kiểm tra còn phát hiện 148 kg nhãn hàng hóa đều ghi “Made in USA”; hơn 95 kg nhãn phụ các loại; 1.520 tem niêm phong nhãn hiệu HUMA GRO.

Kiểm tra sổ sách của Công ty Thuận Phong, từ ngày 1/1/2014 đến thời điểm kiểm tra, Công ty Thuận Phong đã sản xuất và bán ra thị trường trên 40.000 chai phân bón có dán nhãn hiệu “Made in USA” các loại, tương đương trên 23.000 lít phân bón dạng nước.