Các tổng cục trước đây được sắp xếp thành các cục, bên cạnh đó một số đơn vị cấp cục, vụ khác được hợp nhất, thay tên gọi. Sau sắp xếp, Bộ Nông nghiệp và Phát triển nông thôn còn 28 đơn vị.