R25 2016 vẫn có thiết kế tương tự nhiên các phiên bản tiền nhiệm trước đó với kiểu dáng thể thao, với nhiều đường nét góc và được thiết kế theo cảm hứng từ phiên bản YZR-M1.

Yamaha R25 2016 được trang bị động cơ giống như phiên bản trước đó với dung tích 249 phân khối, 2 xy-lanh song song, làm mát bằng dung dịch, sản sinh công suất 35,5 mã lực tại 12.000 v/p và mô-men xoắn cực đại 22,6 Nm ở mức 10.000 v/p kết hợp với hộp số 6 cấp.

Ở phiên bản mới của R25, xe có trọng lượng 166 kg với chiều cao yên ở mức 780 mm và bình xăng dung tích 14,3 lít. Ngoài ra, xe sử dụng bộ mâm kích thước 17 inch với 2 màu đen và xanh, lốp sau có kích thước 140/70. Cả hai bánh trước, sau đều được trang bị hệ thống phanh đĩa

Tại thị trường Malaysia, Yamaha R25 2016 có mức giá bán khởi điểm 20.630 RM (tương đương 118 triệu đồng) với hai đối thủ nặng ký là Kawasaki Ninja 250 và KTM RC 250.