Sự hiện diện của Di tích quốc gia đặc biệt Tháp Hòa Lai trên hướng tuyến dự kiến khiến tỉnh Khánh Hòa phải đề xuất điều chỉnh cục bộ Dự án đường sắt tốc độ cao trên trục Bắc - Nam.