Trong đó, có 6 dự án, công trình đầu tư từ nguồn vốn hỗ trợ có mục tiêu từ ngân sách nhà nước theo Chương trình hỗ trợ đầu tư hạ tầng khu kinh tế ven biển, gồm: Bồi thường, giải phóng mặt bằng và rà phá bom mìn khu Nhà máy lọc hóa dầu Vũng Rô (538ha), tổng kinh phí 483 tỉ đồng; tuyến nối quốc lộ 1 (Đông Mỹ) đến KCN Hòa Hiệp - giai đoạn 1, kinh phí 375 tỉ đồng; tuyến đường Phước Tân - Bãi Ngà, đoạn qua Nhà máy lọc hóa dầu Vũng Rô, kinh phí 489 tỉ đồng; hạ tầng Khu tái định cư xã Hòa Tâm, kinh phí 350 tỉ đồng; tuyến đường nối quốc lộ 1 đến Khu xử lý rác thải, nước thải và chất thải nguy hại của Khu kinh tế Nam Phú Yên, kinh phí 360 tỉ đồng; nhà ở xã hội cho công nhân, kinh phí 380 tỉ đồng.

Cảng Bãi Gốc gắn với Nhà máy lọc dầu Vũng Rô là một trong những danh mục dự án ưu tiên đầu tư của Phú Yên giai đoạn 2016-2020

Đối với các dự án, công trình đầu tư theo các chương trình hỗ trợ khác từ ngân sách nhà nước, có 7 dự án được triển khai, gồm: tiểu dự án 2 - đường từ cầu Hùng Vương đến KCN Hòa Hiệp 1, kinh phí 432 tỉ đồng; tiểu dự án 3 - đường từ KCN Hòa Hiệp 1 đến bắc cầu Đà Nông, kinh phí 222 tỉ đồng; kè chống xói lở ven biển khu vực xóm Rớ, kinh phí 300 tỉ đồng; tuyến nối quốc lộ 1 (Phú Khê) đi KCN Hòa Tâm (Phước Tân), với kinh phí 974 tỉ đồng; điều chỉnh quy hoạch chung Khu kinh tế Nam Phú Yên, điều chỉnh quy hoạch chi tiết Khu đô thị Nam TP Tuy Hòa, Khu phi thuế quan và quy hoạch một số khu chức năng còn lại trong Khu kinh tế Nam Phú Yên, kinh phí 10 tỉ đồng; một số kết cấu hạ tầng Khu đô thị mới Nam TP Tuy Hòa, kinh phí 250 tỉ đồng; kè chống xói lở bờ nam hạ lưu sông Đà Rằng, kinh phí 197 tỉ đồng.

Đối với dự án, công trình hạ tầng dùng chung Nhà máy lọc hóa dầu Vũng Rô đầu tư từ nguồn thuế nhà đầu tư nước ngoài, có 4 dự án, gồm: nạo vét lần đầu thuộc cảng Bãi Gốc, kinh phí 850 tỉ đồng; đê chắn sóng thuộc cảng biển Bãi Gốc, kinh phí 2.662 tỉ đồng; quy hoạch và đầu tư hạ tầng khu hành chính cảng Bãi Gốc, kinh phí 80 tỉ đồng; kênh thoát lũ KCN lọc hóa dầu Hòa Tâm, kinh phí 450 tỉ đồng.