Theo quyết định được phê duyệt, tuyến đường sắt Bến Thành - Cần Giờ có chiều 53,8 km; điểm đầu tại Công viên 23 tháng 9, phường Bến Thành; điểm cuối tại khu đất 39 ha xã Cần Giờ.

Trong giai đoạn 1 chỉ xây dựng 2 nhà ga gồm ga Bến Thành và ga Cần Giờ. Giai đoạn 2 sẽ xây dựng 4 ga gồm ga Tân Thuận, Tân Mỹ, Nhà Bè, Bình Khánh.

Tuyến metro Bến Thành - Cần Giờ sẽ đi qua khu vực bến Nhà Rồng - Khánh Hội.

So với phương án dự kiến trước đây, hướng tuyến mới có sự thay đổi khi dự án đi qua đường Nguyễn Tất Thành để kết nối với bến Nhà Rồng - Khánh Hội. Hướng tuyến mới cũng sẽ đi qua vùng đệm Khu dự trữ sinh quyển Cần Giờ chứ không đi vào vùng lõi.

Cụ thể, hướng tuyến mới sẽ bắt đầu từ khu vực chợ Bến Thành, rồi đi dọc đường Ký Con, vượt rạch Bến Nghé sang đường Vĩnh Khánh, cắt qua đường Hoàng Diệu rồi đi vào đường Nguyễn Tất Thành.

Sau đó, tuyến đi theo hướng đường Nguyễn Văn Linh, qua nút giao cầu Phú Mỹ đến xã Nhà Bè rồi vượt sông Soài Rạp để sang Cần Giờ và đi dọc hành lang đường Rừng Sác để đến điểm cuối tại khu đất rộng 39 ha.

UBND TP.HCM yêu cầu khi triển khai tuyến đường sắt Bến Thành - Cần Giờ cần thực hiện đồng thời với việc mở rộng đường Nguyễn Tất Thành để đảm bảo kết nối hạ tầng và nâng cao hiệu quả đầu tư.

Tuyến đường sắt Bến Thành - Cần Giờ được động thổ vào ngày 19/12/2025, do Công ty cổ phần Đầu tư và phát triển đường sắt cao tốc Vinspeed (Công ty thành viên thuộc Tập đoàn Vingroup) làm chủ đầu tư.

Dự án có tổng mức đầu tư 102.430 tỷ đồng (không bao gồm 12.784 tỷ đồng chi phí giải phóng mặt bằng do nguồn vốn ngân sách nhà nước thực hiện).

Dự kiến, thời gian xây dựng công trình là 30 tháng, đảm bảo thời gian khai thác vận hành trong năm 2028. Sau khi hoàn thành sẽ bố trí 6 đoàn tàu hoạt động, khai thác từ 6 giờ đến 23 giờ, tất cả các ngày trong tuần (tổng thời gian khai thác 17 giờ/ngày).

Thời gian chạy tàu từ Bến Thành đến Cần Giờ là 20,3 phút; thời gian giãn cách giữa các đoàn tàu là 20 phút/chuyến.