Không chỉ tách để điều tra việc lập khống dự án nhằm vay vốn tại SCB, cơ quan công an cũng tách vụ việc có dấu hiệu thiếu trách nhiệm của Bộ Nông nghiệp và Phát triển nông thôn - NN&PTNT (nay là Bộ Nông nghiệp và Môi trường), của Hội đồng Thành viên Vinafood II để tiếp tục điều tra, xác minh làm rõ.